Aplicativos para eBooks

O principal programa para gerenciar eBooks é certamente o Calibre. Ele também é o único que aceita o plugin para DeDRM, utilizado para remover a proteção de PDFs e eBooks (adquiridos no Google Books ou na Amazon, por exemplo).

Para ler PDFs no Kindle (ou Kobo, Nook, etc) é possível utilizar o k2pdfopt para adaptar o tamanho da página ao tamanho da tela. (Se você já tentou ler PDFs no Kindle sabe da dificuldade que é tentar usar a ferramenta de zoom).

Para ler textos em grego, recomendo instalar o LSJ-Kindle, o dicionário Middle Liddell para o Kindle. Lembrando que no Text Critical há vários textos em grego disponíveis em epub/mobi.